Материалы и методы

Учебные материалы по биологии / Моделирование биохимических и генетических процессов в клетке / Материалы и методы

Страница 3

- величина отношения внутри- и внеклеточных концентраций проникающих анионов ()

- величина межмембранного потенциала,

- количество клеток в исследуемом образце

, - величины осмолярности во внутри- () и внеклеточном () пространстве

- интервал между вычислениями каждого последующего цикла

- время эксперимента

- изменение количества раствора в 1 л клеточной воды за время прохождения одного цикла (приращение за )

- заряд иона

- константа Фарадея,

- универсальная газовая постоянная,

- абсолютная температура,

Основные уравнения для клетки

1. Изотоничность

2. Начальная электронейтральность

3. Уравнения потоков

4. Постоянство электронейтральности

5. Вычисление переходов

6. Перераспределение проникающих растворов между клетками и внеклеточной средой

Определения

(D1)

(D2)

(D3)

(D4)

(D5)

(D6)

(D7)

На первом этапе работы программы производится ввод начальных данных о состоянии клетки для осуществления расчета ее исходного состояния (reference state). Все расчеты осуществляются в единицах СГС.

Когда определены параметры исходного состояния клетки, необходимо ввести время эксперимента и интервал между вычислением каждой последующей итерации.

Когда данная операция произведена, мы имеем возможность запустить цикл, условия которого были заданы выше.